Asunto laboral

En octubre me dieron incapacidad pero también mis hojas de riesgo de trabajo por que fue en trayecto hacia el, se le indico a la empresa y me dijeron que no las llenarian y ellos se harían cargo de mi incapacidad al 100% sinceramente no me dio confianza e insistí que se me llenarán hasta enero fue cuando accedieron a llenarmelas pero ellos me siguieron pagando hasta el 30 de diciembre, se tardaron en entregarme mis hojas y nunca me llamaron ni nada para llenarlas y las llenaron mal acudí al seguro y me dijeron que eso podría afectar la calificación del médico del trabajo, cuando me calificaron me lo calificaron como enfermedad general por que llenaron mal las hojas y posteriormente la empresa me dijo que entonces por llenarme mis hojas yo tendría que pagarles lo que ya me habían pagado o si no me demandarían. Mi pregunta es esa si si tengo que pagarles eso? Aparte de que mi incapacidad terminó el 20 de enero y ya estos días siguientes a la quincena no me pagaron nada y yo ya estaba laborando